Метаболомное исследование кардиотоксичности лекарственных препаратов на зебрафиш в качестве модельного организма: эндотелиaльная и митохондриальная дисфункция, окислительный стресс
https://doi.org/10.19163/2307-9266-2025-13-2-70-83
Аннотация
Цель. Исследовать изменения метаболомного профиля эмбрионов Данио-рерио (зебрафиш) при воздействии лекарственных препаратов с известными рисками кардиотоксичности — ацетаминофена, карбамазепина, сальбутамола, кеторолака, бисопролола и метопролола. Анализ нацелен на выявление изменений в уровне аминокислот (в том числе с разветвлённой цепью — ВСАА), продуктов карнитинового обмена (ацилкарнитинов) и связанных метаболических индексов, отражающих митохондриальную дисфункцию, оксидативный стресс и нарушения сигнального пути оксида азота.
Материалы и методы. Эмбрионы Данио-рерио инкубировали с исследуемыми веществами в градиенте концентраций (0,5–10×NOEC). Проводился количественный целевой метаболомный анализ методом высокоэффективной жидкостной хроматографии — тандемной масс-спектрометрии (HPLC–MS/MS) с панелью из 98 метаболитов (аминокислоты, продукты обмена оксида азота, витамины, нуклеозиды и ацилкарнитины). Полученные концентрации метаболитов сравнивали с контролем (0,1% ДМСО). Статистически значимые отклонения выражали как отношение концентрации к контролю в логарифмическом масштабе по основанию 2 (log2FC).
Результаты. Выявлены изменения концентраций ключевых метаболитов под влиянием кардиотоксичных лекарственных препаратов. Наблюдалось накопление ВСАА (сумма лейцин, изолейцин, валин; log2FC≈0,5–2,2; p <0,05) по сравнению с контролем, а также повышение уровня ацилкарнитинов, указывающее на митохондриальную дисфункцию: так, метопролол и бисопролол вызывали увеличение соотношения суммы ацилкарнитинов к свободному карнитину более чем в 4–6 раз (log2FC=+3,8 для бисопролола и –1,27 для метопролола; p <0,01), а также накопление длинноцепочечных ацилкарнитинов. Отмечены выраженные изменения показателей, связанных с оксидативным стрессом: в образцах после воздействия β1-блокаторов (бисопролол, метопролол) и кеторолака повышалась концентрация метионин-сульфоксида (на 80–130%, p <0,01) — продукта окисления метионина, и соотношение метионин-сульфоксид/метионин, тогда как при воздействии сальбутамола, напротив, уровень метионин-сульфоксида снижался (–120%, p <0,01), указывая на разнонаправленное влияние на окислительный статус. Нарушения сигнального пути оксида азота отразились в повышении уровня асимметричного диметиларгинина.
Заключение. Каждое из проанализированных соединений вызывало специфический метаболический «отпечаток» в образцах Данио-рерио, отражающий механизмы их кардиотоксичности. Повышение уровня ВСАА и связанных показателей указывает на нарушение энергетического обмена миокарда, накопление длинноцепочечных ацилкарнитинов свидетельствует о неполном β-окислении жирных кислот. Рост концентрации ADMA ассоциирован с эндотелиальной дисфункцией, а увеличение метионин-сульфоксида — с усилением оксидативного стресса.
Об авторах
Н. Е. МоскалеваРоссия
кандидат биологических наук, заместитель руководителя Центра биофармацевтического анализа и метаболомных исследований Института трансляционной медицины и биотехнологии, ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
П. М. Резванов
Россия
аспирант, младший научный сотрудник лаборатории биоинформатики и фармакологического моделирования Центра биофармацевтического анализа и метаболомных исследований Института трансляционной медицины и биотехнологии, ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
В. М. Самойлов
Россия
студент 5 курса факультета медицинской биохимии, лаборант Центра биофармацевтического анализа и метаболомных исследований Института трансляционной медицины и биотехнологии, ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
В. Г. Варзиева
Россия
младший научный сотрудник Центра биофармацевтического анализа и метаболомных исследований Института трансляционной медицины и биотехнологии, ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4
С. Н. Басханова
Россия
научный сотрудник Центра биофармацевтического анализа и метаболомных исследований Института трансляционной медицины и биотехнологии, ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4
В. В. Тарасов
Россия
доктор фармацевтических наук, директор Института трансляционной медицины и биотехнологии, проректор по научно-технологическому развитию ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
Е. А. Смолярчук
Россия
кандидат медицинских наук, доцент, заведующий кафедрой фармакологии Института фармации им. А.П. Нелюбина ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
Д. А. Кудлай
Россия
доктор медицинских наук, профессор кафедры фармакологии Института фармации им. А.П. Нелюбина ФГАОУ ВО «Первый МГМУ им. И.М. Сеченова» Минздрава России (Сеченовский Университет); заместитель декана по научно-технологическому развитию факультета биоинженерии и биоинформатики, старший научный сотрудник факультета биоинженерии и биоинформатики ФГБОУ ВО МГУ им. М.В. Ломоносова; ведущий научный сотрудник лаборатории персонализированной медицины и молекулярной иммунологии № 71 ФГБУ «ГНЦ “Институт иммунологии”» ФМБА России; член-корреспондент РАН.
1. Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
2. Россия, 119991, г. Москва, Ленинские горы, д. 1.
3. Россия, 115522, г. Москва, Каширское шоссе, д. 24.
С. А. Апполонова
Россия
кандидат химических наук, руководитель Центра биофармацевтического анализа и метаболомных исследований Института трансляционной медицины и биотехнологии, ФГАОУ ВО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский университет).
Россия, 119435, г. Москва, ул. Большая Пироговская, д. 2, стр. 4.
Список литературы
1. Onakpoya I.J., Heneghan C.J., Aronson J.K. Post-marketing withdrawal of 462 medicinal products because of adverse drug reactions: a systematic review of the world literature // BMC Medicine. – 2016. – Vol. 14. – P. 10. DOI: 10.1186/s12916-016-0553-2
2. Ferdinandy P., Baczkó I., Bencsik P., Giricz Z., Görbe A., Pacher P., Varga Z.V., Varró A., Schulz R. Definition of hidden drug cardiotoxicity: paradigm change in cardiac safety testing and its clinical implications // Eur Heart J. – 2018. – Vol. 40, No. 22. – P. 1771–1777. DOI: 10.1093/eurheartj/ehy365
3. Ussher J.R., Elmariah S., Gerszten R.E., Dyck J.R.B. The Emerging Role of Metabolomics in the Diagnosis and Prognosis of Cardiovascular Disease // J Am College Cardiolog. – 2016. – Vol. 68, No. 25. – P. 2850–2870. DOI: 10.1016/j.jacc.2016.09.972
4. Singh A., Bakhtyar M., Jun S.R., Boerma M., Lan R.S., Su L.J., Makhoul S., Hsu P.C. A narrative review of metabolomics approaches in identifying biomarkers of doxorubicin-induced cardiotoxicity // Metabolomics. – 2025. – Vol. 21. – P. 68. DOI: 10.1007/s11306-025-02258-8
5. Rhee E.P., Gerszten R.E. Metabolomics and Cardiovascular Biomarker Discovery // Clin Chem. – 2011. – Vol. 58, No. 1. – P. 139–147. DOI: 10.1373/clinchem.2011.169573
6. Holeček M. Branched-chain amino acids in health and disease: metabolism, alterations in blood plasma, and as supplements // Nutrition & Metabolism. – 2018. – Vol. 15. – P. 33. DOI: 10.1186/s12986-018-0271-1.
7. Gao C., Hou L. Branched chain amino acids metabolism in heart failure // Front Nutrition. – 2023. – Vol. 10. – P. 1279066. DOI: 10.3389/fnut.2023.1279066
8. Kozhevnikova M.V., Belenkov Y.N., Shestakova K.M., Ageev A.A., Markin P.A., Kakotkina A.V., Korobkova E.O., Moskaleva N.E., Kuznetsov I.V., Khabarova N.V., Kukharenko A.V., Appolonova S.A. Metabolomic profiling in heart failure as a new tool for diagnosis and phenotyping // Sci Rep. – 2025. – Vol. 15. – P. 11849. DOI: 10.1038/s41598-025-95553-2
9. Kozhevnikova M.V., Kakotkina A.V., Korobkova E.O., Kuznetsov I.V., Shestakova K.M., Moskaleva N.E., Appolonova S.A., Belenkov Y.N. Metabolomic Panel for the Diagnosis of Heart Failure with Preserved Ejection Fraction // Int J Mol Sci. – 2025. – Vol. 26. – P. 2102. DOI: 10.3390/ijms26052102
10. Aitken-Buck H.M., Krause J., Zeller T., Jones P.P., Lamberts R.R. Long-Chain Acylcarnitines and Cardiac Excitation-Contraction Coupling: Links to Arrhythmias // Front Physiology. – 2020. – Vol. 11. – P. 577856. DOI: 10.3389/fphys.2020.577856
11. Kukharenko A., Brito A., Kozhevnikova M.V., Moskaleva N., Markin P.A., Bochkareva N., Korobkova E.O., Belenkov Y.N., Privalova E.V., Larcova E.V., Ariani A., La Frano M.R., Appolonova S.A. Relationship between the plasma acylcarnitine profile and cardiometabolic risk factors in adults diagnosed with cardiovascular diseases // Clin Chim Acta. – 2020. – Vol. 507. – P. 250–256. DOI: 10.1016/j.cca.2020.04.035
12. Sibal L., Agarwal S.C., Home P.D., Boger R.H. The Role of Asymmetric Dimethylarginine (ADMA) in Endothelial Dysfunction and Cardiovascular Disease // Cur Cardiology Rev. – 2010. – Vol. 6, No. 2. – P. 82–90. DOI: 10.2174/157340310791162659
13. Markin S.S., Ponomarenko E.A., Romashova Y.A., Pleshakova T.O., Ivanov S.V., Bedretdinov F.N., Konstantinov S.L., Nizov A.A., Koledinskii A.G., Girivenko A.I., Shestakova K.M., Markin P.A., Moskaleva N.E., Kozhevnikova M.V., Chefranova Zh.Yu., Appolonova S.A. A novel preliminary metabolomic panel for IHD diagnostics and pathogenesis // Scientific Reports. – 2024. – Vol. 14. – P. 2651. DOI: 10.1038/s41598-024-53215-9
14. Brito-Martins M., Harding S.E., Ali N.N. beta(1)- and beta(2)-adrenoceptor responses in cardiomyocytes derived from human embryonic stem cells: comparison with failing and non-failing adult human heart // Br J Pharmacol. – 2008. – Vol. 153, No. 4. – P. 751–759. DOI: 10.1038/sj.bjp.0707619
15. Asnani A., Moslehi J.J., Adhikari B.B., Baik A.H., Beyer A.M., de Boer R.A., Ghigo A., Grumbach I.M., Jain S., Zhu H.; American Heart Association Council on Basic Cardiovascular Sciences; Cardio-Oncology Science Subcommittee of Council on Genomic and Precision Medicine and Council on Clinical Cardiology; Council on Peripheral Vascular Disease; and Council on Arteriosclerosis, Thrombosis and Vascular Biology. Preclinical Models of Cancer Therapy-Associated Cardiovascular Toxicity: A Scientific Statement From the American Heart Association // Circ Res. – 2021. – Vol. 129, No. 1. – P. e21–e34. DOI: 10.1161/RES.0000000000000473
16. Wang W., Gao X., Liu L., Guo S., Duan J.A., Xiao P. Zebrafish as a Vertebrate Model for High-Throughput Drug Toxicity Screening: Mechanisms, Novel Techniques, and Future Perspectives // J Pharm Analysis. – 2025. – P. 101195. DOI: 10.1016/j.jpha.2025.101195
17. Markin P.A., Brito A., Moskaleva N.E., Tagliaro F., La Frano M.R., Savitskii M.V., Appolonova S.A. Short- and long-term exposures of the synthetic cannabinoid 5F-APINAC induce metabolomic alterations associated with neurotransmitter systems and embryotoxicity confirmed by teratogenicity in zebrafish // Comp Biochem Physiol C Toxicol Pharmacol. – 2021. – Vol. 243. – P. 109000. DOI: 10.1016/j.cbpc.2021.109000
18. Markin P.A., Brito A., Moskaleva N.E., Tagliaro F., Tarasov V.V., La Frano M.R., Savitskii M.V., Appolonova S.A. Short- and medium-term exposures of diazepam induce metabolomic alterations associated with the serotonergic, dopaminergic, adrenergic and aspartic acid neurotransmitter systems in zebrafish (Danio rerio) embryos/larvae // Comp Biochem Physiol Part D Genomics Proteomics. – 2021. – Vol. 38. – P. 100816. DOI: 10.1016/j.cbd.2021.100816
19. Dyballa S., Miñana R., Rubio-Brotons M., Cornet C., Pederzani T., Escaramis G., Garcia-Serna R., Mestres J., Terriente J. Comparison of Zebrafish Larvae and hiPSC Cardiomyocytes for Predicting Drug-Induced Cardiotoxicity in Humans // Toxicol Sci. – 2019. – Vol. 171, No. 2. – P. 283–295. DOI: 10.1093/toxsci/kfz165
20. Zakaria Z.Z., Benslimane F.M., Nasrallah G.K., Shurbaji S., Younes N.N., Mraiche F., Da’as S.I., Yalcin H.C. Using Zebrafish for Investigating the Molecular Mechanisms of Drug-Induced Cardiotoxicity // BioMed Res Int. – 2018. – Vol. 2018. – P. 1642684. DOI: 10.1155/2018/1642684
21. Tusher V.G., Tibshirani R., Chu G. Significance analysis of microarrays applied to the ionizing radiation response // Proc Natl Acad Sci U S A. – 2001. – Vol. 98, No. 9. – P. 5116–5121. – DOI: 10.1073/pnas.091062498
22. Morris C.R., Hamilton-Reeves J., Martindale R.G., Sarav M., Ochoa Gautier J.B. Acquired amino acid deficiencies: a focus on arginine and glutamine // Nutr Clin Pract. – 2017. – Vol. 32, Suppl. 1. – P. 30S–47S.
23. Rees C.A., Rostad C.A., Mantus G., Anderson E.J., Chahroudi A., Jaggi P., Wrammert J., Ochoa J.B., Ochoa A., Basu R.K., Heilman S., Harris F., Lapp S.A., Hussaini L., Vos M.B., Brown L.A., Morris C.R. Altered amino acid profile in patients with SARS-CoV-2 infection // Proc Natl Acad Sci U S A. – 2021. – Vol. 118, No. 25. – P. e2101708118.
24. Masoodi M., Gastaldelli A., Hyötyläinen T., Arretxe E., Alonso C., Gaggini M., Brosnan J., Anstee Q.M., Millet O., Ortiz P., Mato J.M., Dufour J.F., Orešič M. Metabolomics and lipidomics in NAFLD: biomarkers and non-invasive diagnostic tests // Nat Rev Gastroenterol Hepatol. – 2021. – Vol. 18, No. 12. – P. 835–856. DOI: 10.1038/s41575-021-00502-9
25. Leonetti S., Herzog R.I., Caprio S., Santoro N., Tricò D. Glutamate–serine–glycine index: a novel potential biomarker in pediatric non-alcoholic fatty liver disease // Children. – 2020. – Vol. 7, No. 12. – P. 270.
26. Da Silva K.M., Iturrospe E., Bars C., Knapen D., Van Cruchten S., Covaci A., Van Nuijs A.L.N. Mass spectrometry-based zebrafish toxicometabolomics: a review of analytical and data quality challenges // Metabolites. – 2021. – Vol. 11, No. 9. – P. 635. DOI: 10.3390/metabo11090635
27. Moskaleva N.E., Shestakova K.M., Kukharenko A.V., Markin P.A., Kozhevnikova M.V., Korobkova E.O., Brito A., Baskhanova S.N., Mesonzhnik N.V., Belenkov Y.N., Pyatigorskaya N.V., Tobolkina E., Rudaz S., Appolonova S.A. Target Metabolome Profiling-Based Machine Learning as a Diagnostic Approach for Cardiovascular Diseases in Adults // Metabolites. – 2022. – Vol. 12, No. 12. – P. 1185. DOI: 10.3390/metabo12121185
28. Drygała S., Radzikowski M., Maciejczyk M. β-blockers and metabolic modulation: unraveling the complex interplay with glucose metabolism, inflammation and oxidative stress // Front Pharmacol. – 2024. – Vol. 15. – P. 1489657.DOI: 10.3389/fphar.2024.1489657
29. Förstermann U., Sessa W.C. Nitric oxide synthases: regulation and function // European Heart Journal. – 2012. – Vol. 33, No. 7. – P. 829–837. DOI: 10.1093/eurheartj/ehr30
30. Adding L.C., Agvald P., Artlich A., Persson M.G., Gustafsson L.E. Beta-adrenoceptor agonist stimulation of pulmonary nitric oxide production in the rabbit // Br J Pharmacol. – 1999. – Vol. 126, No. 3. – P. 833–839. – DOI: 10.1038/sj.bjp.0702369
31. Cheng M.L., Wang C.H., Shiao M.S., Liu M.H., Huang Y.Y., Huang C.Y., Mao C.T., Lin J.F., Ho H.Y., Yang N.I. Metabolic disturbances identified in plasma are associated with outcomes in patients with heart failure: diagnostic and prognostic value of metabolomics // J Am Coll Cardiol. – 2015. – Vol. 65, No. 15. – P. 1509–1520. DOI: 10.1016/j.jacc.2015.02.018
32. Sabbatino F., Conti V., Liguori L., Polcaro G., Corbi G., Manzo V., Tortora V., Carlomagno C., Vecchione C., Filippelli A., Pepe S. Molecules and mechanisms to overcome oxidative stress inducing cardiovascular disease in cancer patients // Life. – 2021. – Vol. 11, No. 2. – P. 105. DOI: 10.3390/life11020105
33. Ramachandran A., Duan L., Akakpo J.Y., Jaeschke H. Mitochondrial dysfunction as a mechanism of drug-induced hepatotoxicity: current understanding and future perspectives // J Clin Translat Res. – 2018. – Vol. 4, No. 1. – P. 75–100. DOI: 10.18053/jctres.04.201801.005
34. Bashir S., Morgan W.A. Inhibition of mitochondrial function: An alternative explanation for the antipyretic and hypothermic actions of acetaminophen // Life Sci. – 2023. – Vol. 312. – P. 121194. DOI: 10.1016/j.lfs.2022.121194
35. Hosohata K. Role of Oxidative Stress in Drug-Induced Kidney Injury // Int J Mol Sci. – 2016. – Vol. 17, No. 11. – P. 1826. DOI: 10.3390/ijms17111826.
36. Fine K.S., Wilkins J.T., Sawicki K.T. Circulating branched chain amino acids and cardiometabolic disease // J Am Heart Association. – 2024. – Vol. 13. – P. e031617. DOI: 10.1161/JAHA.123.031617
37. Truby L.K., Regan J.A., Giamberardino S.N., Ilkayeva O., Bain J., Newgard C.B., O’Connor C.M., Felker G.M., Kraus W.E., McGarrah R.W., Shah S.H. Circulating long chain acylcarnitines and outcomes in diabetic heart failure: an HF-ACTION clinical trial substudy // Cardiovasc Diabetol. – 2021. – Vol. 20, No. 1. – P. 161. DOI: 10.1186/s12933-021-01353-z
Рецензия
Для цитирования:
Москалева Н.Е., Резванов П.М., Самойлов В.М., Варзиева В.Г., Басханова С.Н., Тарасов В.В., Смолярчук Е.А., Кудлай Д.А., Апполонова С.А. Метаболомное исследование кардиотоксичности лекарственных препаратов на зебрафиш в качестве модельного организма: эндотелиaльная и митохондриальная дисфункция, окислительный стресс. Фармация и фармакология. 2025;13(2):70-83. https://doi.org/10.19163/2307-9266-2025-13-2-70-83
For citation:
Moskaleva N.E., Rezvanov P.M., Samoylov V.M., Varzieva V.G., Baskhanova S.N., Tarasov V.V., Smolyarchuk E.A., Kudlay D.A., Appolonova S.A. Metabolomics in drugs research on zebrafish-based cardiotoxicity models: endothelial and mitochondrial dysfunction, oxidative stress. Pharmacy & Pharmacology. 2025;13(2):70-83. (In Russ.) https://doi.org/10.19163/2307-9266-2025-13-2-70-83